分子蒸餾器是一個在1~0.001mbar真空壓力下受熱分離的技術過程，較低的揮發溫度，非常適合熱敏性、高沸點物。
蒸發裝置基本部件：加熱夾套的圓柱型筒體（直徑可選），轉子和內置冷凝器（短程冷凝）；在轉子上附有刮膜器和防飛濺裝置，內置冷凝器位于蒸發器的中心（短程冷凝手記），轉子在圓柱型筒體和冷凝器之間旋轉。由外加熱的垂直圓筒體、位于它的中心冷凝器及在蒸餾器和冷凝器之間旋轉的刮膜器組成。

蒸餾過程是：物料從蒸發器的頂部加入，經轉子上的料液分布器將其連續均勻地分布在加熱面上，隨即刮膜器將料液刮成一層極薄、呈湍流狀的液膜，并以螺旋狀向下推進。在此過程中，從加熱面上逸出的輕分子，經過短的路線和幾乎未經碰撞就到內置冷凝器上冷凝成液，并沿冷凝器管流下，通過位于蒸發器底部的出料管排出；殘液即重分子在加熱區下的圓形通道中收集，再通過側面的出料管中流出。