當實驗室級別為一級時一般無須使用生物安全柜，或使用Ⅰ級生物安全柜。實驗室級別為二級時，當可能產生微生物氣溶膠或出現濺出的操作時，可使用Ⅰ級生物安全柜；當處理感染性材料時，應使用部分或全部排風的Ⅱ級生物安全柜；若涉及處理化學致癌劑、放射性物質和揮發性溶媒，則只能使用Ⅱ-B級全排風(B2型)生物安全柜。實驗室級別為三級時，應使用Ⅱ級或Ⅲ級生物安全柜；所有涉及感染材料的操作，應使用全排風型Ⅱ-B級(B2型)或Ⅲ級生物安全柜。實驗室級別為四級時，應使用Ⅲ級全排風生物安全柜，可使用Ⅱ-B級生物安全柜。